Будущий писатель родился 16 июля 1960 на Урале в семье военнослужащего. Семья часто переезжала, и за время учебы в школе Сергей сменил пять городов в России, Украине и Казахстане. В 1983 году он окончил Московский авиационный институт по специальности прикладная математика. Работал в закрытом НИИ, в 1988 году стал кандидатом технических наук. После распада СССР стал предпринимателем.
В 80-х Сергей Бакшеев дебютировал как автор юмористических рассказов, которые публиковались в журналах, газетах и на радио. Серьёзную прозу Бакшеева, как ни странно, впервые заметили в ФРГ: в 1992 он стал лауреатом премии радиостанции «Deutsche Welle» за лучший рассказ («Парад»). Известность приобрел как автор остросюжетных романов, детективов и триллеров. Из них наиболее известны романы «Невеста Аллаха», «Композитор», «Светлый демон», серия детективов «Петля». Некоторые романы писателя переведены английский язык, в частности психологический детектив «Тайная мишень», а также на испанский язык, например, «Математик» и «Череп Тимура».
На ЛитРес можно скачать и читать онлайн большинство книг Сергея Бакшеева или прослушать озвученные версии.